Les nombreux atouts de la région Centre expliquent le développement du bassin de production de semences :

Un contexte agropédoclimatique très favorable.
Des possibilités d'irrigation notamment via la nappe de Beauce et autres nappes captives.
De bonnes conditions environnementales (zones protégées en seigle hybrides et betteraves, absence de certaines adventices comme les carottes sauvages).
Des agriculteurs multiplicateurs dont la technicité est reconnue, bien équipés, produisant plutôt sur de grandes surfaces.
Des Etablissements multiplicateurs implantés dans la zone.
Des débouchés locaux importants pour les semences pondéreuses.
Une bonne structuration de la filière à travers l'interprofession, présente localement.
Des stations d'expérimentation qui permettent de diffuser les nouvelles techniques de production et de maintenir le niveau technique des agriculteurs multiplicateurs.
Une implication significative du réseau des chambres d'agriculture.
Des partenariats techniques engagés avec les autres filières de productions comme la filière apicole (ADAPIC), les filières grandes cultures (ARVALIS, CETIOM) ou légumes (LCA).

Toutefois, la filière semences régionale doit également faire face à des difficultés :

Le durcissement de la réglementation phytosanitaire peut conduire à des impasses techniques.

Les contraintes réglementaires issues du Grenelle de l'Environnement et de la révision au plan communautaire de la directive 91-414 (projet de règlement du 13 janvier 2009) ont des répercussions importantes en production de semences : moins de produits phytopharmaceutiques autorisés pourraient conduire à des impasses techniques dans certains cas.

L'adaptation des producteurs au durcissement de la réglementation phytosanitaire est en enjeu primordial pour maintenir, voire développer les surfaces dans la Région.

Le durcissement de la réglementation environnementale entoure la production d'un faisceau de contraintes.
Comme l'ensemble de la production agricole, les productions de semences sont soumises à des restrictions d'utilisation en matière d'eau d'irrigation. Globalement, ces productions soient moins consommatrices en eau que d'autres cultures, toutefois l'apport d'eau d'irrigation peut être indispensable à certains stades de la culture.

Les contraintes accrues sur les conditions de production des semences certifiées ou contrôlées sont d'autant plus préjudiciables que la semence, vecteur du progrès génétique, est un des moyens de permettre à l'agriculture de répondre aux défis du Grenelle.

La diminution du nombre de producteurs.
Plusieurs années climatiques difficiles successives et l'attractivité du prix des grandes cultures sur les campagnes 2007 et 2008 ont contribué à détourner une partie des agriculteurs des productions de semences.
La baisse du nombre d'agriculteurs multiplicateurs entre 2000 et 2007 s'établit à 32% tandis que sur la même période, la baisse du nombre d'exploitations sur la Région n'est que de 17% (source Agreste - sur bases statuts des exploitations).

La pollinisation des surfaces en multiplication.
La pollinisation par les abeilles est fondamentale pour un certain nombre de productions de semences allogames (potagères, légumineuses, oléagineux...).

Les freins en production de semences biologiques.
La production de semences bio doit répondre à la fois aux contraintes de la réglementation bio et aux contraintes de la production de semences (normes de pureté, de germination, sanitaires...).

La formation et le recrutement des opérateurs.
La Région compte plusieurs lycées formant aux métiers de l'agriculture mais une seule formation qui peut concerner la demande de la filière semences à savoir le BTSA Technologies Végétales.

L'animation de la zone de production semences potagères de Beauce.
Les agriculteurs multiplicateurs de la zone potagère de Beauce sont décentrés par rapport à la station FNAMS basée dans le Cher pour les raisons historiques évoquées plus haut. La station FNAMS reste par ailleurs très bien positionnée par rapport aux cultures de semences fourragères et de céréales.